Bár tökéletesen ember kinézetű, vannak apró eltérések, testfelépítése pedig teljesen eltér az emberekétől. Két szíve van, ezzel együtt kettős érhálózata, mely hasznos is, és nem is. A sorozat kezdetén elég volt ennyi, hogy máris magával ragadjon az időutazás már-már varázslatos világa. Az érdekes főszereplőnek hála a Doctor Who igen elterjedt sorozattá vált 1966-ra, de ekkor a Doktor, William Hartnell kénytelen volt elhagyni a TARDIS fedélzetét rossz egészségi állapota miatt. De mivel nem tervezték még befejezni a sorozatot, kellett valakit keresni, aki örökli a Doktor szerepét. Választásuk Patrick Troughton-ra esett, de túl feltűnő lett volna az idős vékony öregember helyett egy fekete hajú 40-es éveiben járó alacsony színészt beállítani. Ekkor született meg az az ötlet, hogy Gallifrey gyermekei, az Idő Lordok képesek végelgyengülés(ha náluk létezik ilyen), vagy halálos sérülés, betegség esetén regenerálódni. A "Dobok hangja" című epizód arra utal, hogy az Idő Lordok nem halhatnak természetes halált regenerációs képesség nélkül sem, de ezen képességük többet nyújt: Ha az Idő Lord halálos sérülést kap, akkor szervezete automatikusan újrarendezi testének sejtjeit, melynek következtében jelentősen megváltozik a hangja, arca, és ritkán személyisége is. Persze a regenerációt megindíthatja ő maga is, ha úgy érzi, fiatal testre van szüksége, mely "erős, és sérthetetlen", ugyanakkor ilyen könnyen meg is tagadhatja, mint példaképp a Mester "Az utolsó Idő Lord" című epizódban. A folyamat általában 1-2 perc alatt ment végbe, miközben a Doktor a földön fekve korábbi inkarnációit felismerve, és a TARDIS zúgását hallgatva várja, hogy sérülése eltűnjön, és a homályos fényárból új arccal keljen fel. Ezért beszélünk második, vagy negyedik Doktorról.

 

A nyolcadik Doktor már villámlás közepette rendezte át arcát, mintha egy szobrász formálta volna meg. A kilencedik Doktornál jelent meg a végső verzió, mely két hullámból áll: (1) Először előtör az aranyszínű gáz, részecskéi átrendeződnek, sérülése eltűnik, ezalatt (2) felhalmozódik a fölösleges regenerációs energia, amit úgy tüntet el, hogy kisebb, fölöslegesebb hibákat kezd el helyreállítani, így változik meg hangja és arca. A gáz elszivárog, ezt enyhe sokk követi(volt olyan Doktor, aki például regeneráció után meg akarta fojtani útitársát), memóriazavar, átmeneti amnézia is bekövetkezhet, ezután lassan megismeri megváltozott személyiségét, hogy mit szeret enni, mit nem szeret, kedves-e, vagy goromba. Persze megtörténik, hogy a fölös energia nem szívódik fel teljesen, ilyenkor ezt arany színű gáz képében köhögi ki. Ez gyakori jelenség, mely a regeneráció második fázisától számított 15 óra. Ez alatt a 15 óra alatt az Idő Lord új teste kiáramoltatja a fölösleges regenerációs energiát, melyből még olyan sok van testében, hogy ha (mint a tizedik Doktor esetében) levágják egy végtagját, azt nehezen, de újra tudja növeszteni.